Как правильно заключить договор на вывоз мусора, при наличии нескольких квартир?

Договор с региональным оператором носит публичный характер, плата за обращение с ТКО является обязательной.  Вам следует заключать такой договор лишь в том случае, если собственники непосредственно управляют многоквартирным домом, либо на общем собрании было принято решение о заключении договоров с ресурсоснабжающими организациями. В остальных случаях договор за всех собственников заключает управляющая компания или ТСЖ. 

Согласно ст. 155 ЖК РФ отсутствие договора, как и уклонение от его заключения, не освобождает вас от обязанности оплаты за услугу по обращению с ТКО. Квитанции, приходящие вам по трём квартирам обоснованы. Вы, как собственник квартир, обязаны  вносить оплату своевременно и в полном объёме по всем адресам, а не только по тому, где живёте.

Если вы находитесь в отъезде, либо, например, учитесь в другом городе, то возможен перерасчёт. В этом случае вы должны предоставить оператору соответствующее заявление и справку по месту пребывания.  В случае заключения договора, помимо ваших данных, необходимо указать количество зарегистрированных с вами лиц, поскольку это влияет на размер оплаты, предоставляемой услуги.